Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms