Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms