Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms