Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms