Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPG4P5Q96PW8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms