Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms