Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NXPE2Q96DL1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms