Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms