Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms