Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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