Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF3AQ92664 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms