Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms