Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113Q902F9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms