Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms