Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms