Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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