Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APCDD1LQ8NCL9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms