Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM5Q71RC9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms