Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEND4Q6ZU67 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms