Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms