Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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