Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC8Q6A555 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC8Q6A555 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms