Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms