Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms