Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms