Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHKAPQ2M3C7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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