Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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RTL8BQ17RB0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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RTL8BQ17RB0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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RTL8BQ17RB0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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RTL8BQ17RB0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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