Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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