Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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