Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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