Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CST6Q15828 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CST6Q15828 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CST6Q15828 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms