Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPEGQ15772 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms