Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHBQ15464 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHBQ15464 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHBQ15464 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHBQ15464 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHBQ15464 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHBQ15464 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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