Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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