Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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