Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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