Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms