Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPSQ13938 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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