Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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