Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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