Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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