Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME3Q13232 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME3Q13232 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME3Q13232 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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NME3Q13232 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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