Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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