Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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