Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM2Q13029 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
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