Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms