Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms