Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms