Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms