Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms